Facture électronique auto-entrepreneur 2027 : guide + top PA

Si vous êtes auto-entrepreneur ou micro-entrepreneur en France, la réforme de la facturation électronique vous concerne directement à partir du 1^er septembre 2027. À cette date, toute facture émise vers une autre entreprise française (B2B) devra transiter par une Plateforme Agréée (PA, ex-PDP) dans un format structuré (Factur-X, UBL ou CII). Le Portail Public de Facturation (PPF), recentré le 15/10/2024, ne propose plus d’émission ni de réception directe — il sert uniquement d’annuaire des destinataires et de concentrateur e-reporting. La facture PDF non structurée envoyée par email — pratique encore majoritaire chez les micro-entrepreneurs en 2026 — perd sa validité légale. Ce guide explique précisément ce qui change pour un auto-entrepreneur, comment choisir une plateforme adaptée à votre statut, et compare les cinq solutions les plus populaires (Indy, Tiime, Pennylane, Sellsy, Sage) avec tarifs réels sourcés.

Pourquoi vous êtes concerné en tant qu’auto-entrepreneur

Le statut d’auto-entrepreneur (officiellement micro-entrepreneur depuis 2016) ne vous exonère pas de la réforme. Le critère retenu par l’administration fiscale est le statut d’assujetti à la TVA et la qualité d’entreprise française émettant des factures B2B — pas la taille de la structure ni le régime social.

Vos particularités micro-entreprise

Quelques rappels qui pèsent sur le choix d’une plateforme :

• Franchise en base de TVA : tant que votre chiffre d’affaires reste sous le seuil de 37 500 €/an (prestations de services BIC et BNC, tolérance majorée 41 250 €) ou 85 000 €/an (vente de marchandises BIC, tolérance 93 500 €) — seuils 2026 indexés annuellement (art. 293 B CGI). Vous facturez sans TVA et indiquez la mention « TVA non applicable, art. 293 B du CGI ». Au-delà, vous basculez en TVA classique. Note : la proposition LF 2025 d’un seuil unique abaissé à 25 000 € a été abandonnée.
• BIC vs BNC : les bénéfices industriels et commerciaux (BIC) couvrent commerce, artisanat, services commerciaux ; les bénéfices non commerciaux (BNC) couvrent professions libérales, conseil, formation. Cette distinction influence le choix de plateforme — certains éditeurs comme Indy sont historiquement orientés BNC.
• Déclaration URSSAF mensuelle ou trimestrielle : votre chiffre d’affaires déclaré à l’URSSAF doit refléter exactement les factures émises. Une plateforme qui automatise cette remontée vous évite la double saisie.
• Comptabilité allégée : vous tenez un livre des recettes (et des achats si vous vendez des marchandises), sans bilan ni TVA déductible — sauf si vous renoncez volontairement à la franchise.

Concrètement, plusieurs millions d’auto-entrepreneurs actifs en France (chiffres à vérifier sur les publications URSSAF¹ en vigueur) sont concernés par la migration. Et même un auto-entrepreneur qui ne facture qu’à des particuliers (B2C) est touché : il devra transmettre les données de ces transactions en e-reporting via une Plateforme Agréée, à partir du 1^er septembre 2027 (le PPF ne fait plus émission ni saisie manuelle utilisateur final²).

Calendrier précis pour les auto-entrepreneurs

Deux dates structurent la mise en conformité :

e-invoicing vs e-reporting : quelle différence pour vous

• e-invoicing = transmission technique d’une facture B2B française d’une PA à une autre PA. Concerne vos clients entreprises françaises.
• e-reporting = transmission à l’administration des données de transactions hors champ e-invoicing : ventes B2C (particuliers), ventes à l’export, achats à l’import, données d’encaissement. Le format est plus léger qu’une facture complète mais reste structuré.

Calendrier détaillé →

L’exception franchise TVA : ce qui change (peu)

Question fréquente : « Si je suis en franchise de TVA, suis-je quand même concerné ? ». Oui. La franchise en base de TVA ne dispense pas de l’obligation de facturation électronique. Elle a deux conséquences techniques :

• Vos factures continuent de mentionner « TVA non applicable, art. 293 B du CGI » — la PA gère cette mention nativement.
• Vos données de TVA agrégées remontées à l’administration affichent zéro TVA collectée — ce qui est cohérent avec votre statut.

À l’inverse, si vous renoncez à la franchise (option pour la TVA classique) ou si vous dépassez le seuil, votre PA prend en charge la collecte et la déclaration TVA — c’est précisément l’un des arguments revendiqués par Indy³ et Pennylane⁴ sur ce segment.

Le choix d’une plateforme agréée : 5 critères auto-ent-spécifiques

Le choix d’une PA pour un auto-entrepreneur n’est pas le même que pour une PME 20 personnes. Cinq critères structurent la décision.

1. Plan gratuit ou payant

C’est le critère n°1 sur ce segment. Plusieurs PA proposent un plan gratuit conforme suffisant pour un volume de 20 à 50 factures par mois — typique d’un auto-entrepreneur. C’est le cas de Indy (plan Essentiel à 0 €) et de Tiime (plan Free gratuit à vie). Pennylane documente désormais une offre 0 € réservée aux micro-entreprises (sinon plan Starter 7 €/mois HT) ; Sellsy ne publie pas de tarif public sur son plan d’entrée, et Sage fonctionne sur devis personnalisé. Pour un démarrage solo avec faible CA, le plan gratuit est suffisant pour la conformité 2027 — vous pourrez toujours basculer plus tard.

2. Intégration URSSAF et déclarations sociales

Atout différenciant pour l’auto-entrepreneur : la capacité de la plateforme à automatiser la déclaration URSSAF mensuelle ou trimestrielle à partir du chiffre d’affaires effectivement encaissé. Sur ce point, Indy revendique³ aller le plus loin (déclarations URSSAF, TVA et impôt sur le revenu intégrées dans le même flux). Tiime documente⁵ l’export comptable et le lien avec un cabinet partenaire. Pennylane et Sellsy laissent l’URSSAF de côté — l’export se fait via le cabinet ou manuellement.

3. Mobile-first et saisie terrain

Un auto-entrepreneur facture souvent depuis le terrain — chantier, atelier, rendez-vous client. La capacité à émettre un devis ou une facture depuis une application mobile mature (iOS et Android) sans repasser par l’ordinateur est un gain de temps réel. Indy, Tiime, Pennylane et Sellsy disposent d’applications mobiles fonctionnelles. Sage et Cegid sont historiquement plus desktop-first.

4. Simplicité d’usage

Le temps consacré à la facturation est un coût caché. Une plateforme qui vous demande deux heures de paramétrage initial et un onboarding complexe est inadaptée à un solo. Indy et Tiime sont les plus simples à prendre en main (15-30 minutes d’onboarding annoncés par les éditeurs³⁵). Pennylane et Sellsy demandent un peu plus de temps en raison de la richesse fonctionnelle (CRM, trésorerie). Cegid et Sage documentent⁶⁷ des gammes calibrées pour des structures établies, avec un déploiement plus long incluant souvent un accompagnement par un partenaire intégrateur.

5. Cabinet comptable optionnel

Si vous avez un expert-comptable (rare en auto-entreprise, plus fréquent en BNC libéral), demandez-lui sa liste d’outils acceptés avant de choisir. Pennylane et Tiime ont des écosystèmes cabinet très matures. Indy joue à l’inverse la carte de l’autonomie sans comptable. Sellsy s’intègre à Pennylane et Cegid pour la remontée comptable.

Top 5 plateformes pour auto-entrepreneurs

Sur les 138 Plateformes Agréées immatriculées au 23 juin 2026 (152 au registre), voici les cinq qui ressortent comme les plus pertinentes pour un auto-entrepreneur, avec leurs tarifs réels sourcés sur les sites éditeurs.

Indy — le plan gratuit qui couvre tout pour un solo BNC

Indy est immatriculée Plateforme Agréée le 9 janvier 2026. Sa proposition de valeur centrale tient en une ligne : permettre à un indépendant de gérer sa facturation, sa TVA et ses déclarations URSSAF sans cabinet comptable. Le plan Essentiel est gratuit et couvre la facturation, le devis, la déclaration TVA, l’URSSAF et l’export comptable — soit l’essentiel pour un auto-entrepreneur. Les plans Plus à 9 €/mois HT et Premium (voir grille publique⁸) ajoutent automatisations et accompagnement comptable optionnel (sources : indy.fr/tarifs, fetched 2026-05-03).

Indy est positionné sur le segment BNC indépendant (consultants, professions libérales, conseil) selon sa propre page À propos. Limites documentées : mono-utilisateur (bloquant dès qu’une équipe se forme), intégrations bancaires limitées (Qonto principalement annoncé sur la page intégrations), pas de support téléphonique. Pour un auto-entrepreneur solo qui veut la conformité 2027 sans sortir de cash, Indy est l’option la plus crédible parmi les PA testées.

Tiime — l’écosystème solo + cabinet partenaire

Tiime est immatriculée Plateforme Agréée le 18 décembre 2025 (nom officiel « TIIME PDP »). L’écosystème combine Tiime Apps (factures + devis), Tiime Compta (collaboration cabinet) et Tiime Business (compte pro avec IBAN français + Mastercard). Le plan Free est gratuit à vie, les plans Smart à partir de 17,99 €/mois HT et Business à partir de 24,99 €/mois HT ajoutent fonctionnalités avancées et signature électronique (sources : tiime.fr/tarifs, fetched 2026-05-03).

Tiime cible les auto-entrepreneurs BIC services et les TPE 1-3 personnes ayant déjà un comptable ou souhaitant utiliser le réseau de cabinets partenaires Tiime⁵. Limites : pas de modules métier BTP (pas de devis chantier, pas de retenue de garantie). Pour un solo qui veut consolider compte pro, factures et lien cabinet dans un seul outil français, Tiime⁵ revendique un compte bancaire intégré là où Indy n’en publie pas.

Pennylane — le saut vers la TPE en croissance

Pennylane est immatriculée Plateforme Agréée le 11 décembre 2025. La fintech française couvre facturation, pré-comptabilité, gestion de trésorerie et collaboration cabinet-client. L’éditeur documente une offre 0 € réservée aux micro-entreprises (émission/réception conformes) ; le plan Starter démarre à 7 €/mois HT (1 utilisateur), le plan Basique à 14 €/mois HT (1 utilisateur, 1 200 factures/an), le plan Essentiel à 24 €/mois HT ajoute automatisations et API, le plan Premium à 79 €/mois HT inclut le module compta complet et les déclarations TVA (sources : pennylane.com/fr/tarifs, fetched 2026-07-02).

Pennylane est moins adapté à l’auto-entrepreneur strict (le YAML interne le marque auto_entrepreneur_friendly: false) car son rapport prix-prestations vise plutôt la TPE-PME 5-50 personnes avec cabinet comptable externe. Cela dit, un auto-entrepreneur en croissance qui anticipe le passage en SASU ou en SARL trouve dans Pennylane une plateforme qui suit l’évolution sans changer d’outil. Intégrations natives Qonto, Stripe, Cegid, Sage, Indy.

Sellsy — la suite CRM pour les auto-ent commerciaux

Sellsy est immatriculée Plateforme Agréée le 24 décembre 2025. La société française combine CRM, facturation, gestion commerciale et pré-comptabilité dans une suite SaaS. Tarifs détaillés non publics (sur devis selon le module et la taille équipe — source : sellsy.com).

Sellsy se distingue d’Indy et de Tiime sur le pipeline commercial intégré : pour un auto-entrepreneur ayant une dimension commerciale forte (cuisiniste, installateur, fournisseur, formateur avec cycle de vente long), vous gagnez le pipeline commercial visualisé, les relances automatiques et les liens de paiement intégrés (Stripe, GoCardless). À l’inverse, pour un solo en chantier ou un BNC sans commercial, le périmètre fonctionnel de Sellsy se justifie surtout à partir d’un volume de prospects et d’un cycle de vente significatifs. La Plateforme Agréée du 24 décembre 2025 sécurise la conformité 2027.

Sage — moins adapté sauf migration

Sage est immatriculée Plateforme Agréée le 22 décembre 2025⁹. L’éditeur britannique implanté en France documente⁷ plusieurs solutions (Sage 50cloud, Sage 100cloud, Sage Compta&Facturation Cloud) couvertes par le statut PA. Tarifs sur devis personnalisé.

Pour un auto-entrepreneur, le rapport coût-fonctionnalités de Sage se justifie surtout à partir d’une certaine taille d’équipe et d’un usage ERP de gestion déjà installé : déploiement plus complexe, écosystème pensé pour les PME établies. Sage redevient pertinent dans un seul cas : vous reprenez une activité auto-entrepreneur après avoir géré une structure équipée Sage, et vous voulez la continuité documentaire et comptable. Pour les autres profils auto-entrepreneur, Indy³, Tiime⁵ ou Pennylane⁴ documentent un périmètre fonctionnel adapté (plan gratuit, BNC, multi-utilisateurs) avec un onboarding plus court.

À noter : Cegid (Plateforme Agréée 18/12/2025) joue dans la même cour que Sage — éditeur historique enterprise, gamme orientée cabinets comptables et ETI/PME 20+ salariés. Hors périmètre auto-entrepreneur sauf cas très spécifique.

Comment passer concrètement à la facture électronique

Six étapes structurent la migration, à étaler entre l’été 2026 et le printemps 2027 pour ne pas atterrir en saturation chez les éditeurs.

1. Choisir votre PA — utilisez le comparateur structuré pour identifier les 2-3 plateformes adaptées à votre statut, votre budget et votre métier. Vérifiez la date d’immatriculation sur la liste officielle DGFiP.
2. Créer le compte — plusieurs PA proposent un essai gratuit ou un plan gratuit suffisant pour démarrer (cf. tableau ci-dessus). Inscrivez-vous avec votre adresse email professionnelle et préparez votre numéro SIRET.
3. Valider le SIRET — la PA vérifie votre immatriculation au registre des entreprises (typiquement via une API Pappers ou Insee selon l’éditeur). Si vous êtes auto-entrepreneur récent, assurez-vous que votre SIRET est bien actif et que les données INSEE sont à jour.
4. Paramétrer — renseignez votre identité commerciale (nom, adresse, SIRET, mention de TVA — « TVA non applicable, art. 293 B du CGI » si franchise), votre logo, vos coordonnées bancaires (IBAN), votre numéro RCS si applicable, et vos modèles de facture/devis.
5. Tester en parallèle — pendant 1 à 2 mois, émettez vos factures sur la PA en parallèle de votre méthode actuelle (Excel, Word, ancien logiciel). Vérifiez le format Factur-X généré, l’envoi correct au client, et le miroir comptable.
6. Basculer définitivement — une fois confiant, abandonnez l’ancien outil et utilisez exclusivement la PA. Récupérez l’historique des factures de l’ancien outil et archivez-le séparément (les PA ne reprennent pas l’historique pré-migration).

Conseil : ne migrez pas en pleine période d’activité (printemps ou rentrée). Privilégiez janvier-février ou un creux saisonnier de votre métier.

Sanctions en cas de non-conformité 2027

L’article 1737 III du Code général des impôts prévoit une amende de 50 € par facture non émise au format électronique conforme, plafond annuel 15 000 €. L’article 1788 D du CGI prévoit une amende de 500 € par transmission e-reporting manquante, plafond annuel 15 000 €. Mécanismes de modulation et de bonne foi prévus par le CGI — modalités précises à confirmer avec votre conseil au regard du texte en vigueur.

Au-delà de l’amende, deux conséquences pratiques pèsent :

• Blocage du paiement client : un client B2B obligé d’utiliser une PA pour réceptionner ses factures ne pourra plus payer une facture papier ou PDF non structurée. Vos factures seront rejetées en réception.
• Risque pour la déduction TVA côté client : selon la doctrine fiscale, le droit à déduction de TVA est conditionné à la détention d’une facture conforme. Une facture non conforme à l’obligation de format électronique peut donc en principe affecter l’exercice du droit à déduction côté client — modalités précises à confirmer avec votre conseil.

Les contrôles débuteront progressivement après septembre 2027. Aucun mécanisme officiel de tolérance technique transitoire n’a fait l’objet d’un communiqué DGFiP triangulable à la date de cette page — se référer aux textes en vigueur et à la doctrine BOFiP. Sanctions 2027 détaillées →

FAQ étendue

Suis-je vraiment concerné si je suis en franchise de TVA ?

Oui. La franchise en base de TVA (art. 293 B du CGI) ne dispense pas de l’obligation de facturation électronique. La PA gère nativement la mention « TVA non applicable » et les données remontées à l’administration affichent simplement une TVA à zéro.

Puis-je utiliser le PPF plutôt qu’une PA payante ?

Non — depuis le recentrage du 15/10/2024, le Portail Public de Facturation (PPF) ne propose plus d’émission ni de réception directe. Il sert uniquement d’annuaire des destinataires et de concentrateur e-reporting. Toute entreprise française doit choisir une Plateforme Agréée (PA) pour émettre/recevoir des factures B2B. Pour un auto-entrepreneur peu factureur, deux PA annoncent⁸¹⁰ un plan gratuit conforme à vie : Indy plan Essentiel et Tiime plan Free.

Quelle plateforme est la moins chère ?

À 0 € : Indy plan Essentiel et Tiime plan Free sont les deux options gratuites conformes Plateformes Agréées. Choisir entre les deux dépend du profil : Indy pour un BNC libéral autonome (déclarations URSSAF intégrées), Tiime pour un BIC services voulant un compte bancaire intégré et un cabinet comptable partenaire.

Faut-il un expert-comptable ?

Non, l’auto-entreprise n’oblige pas à avoir un expert-comptable. Indy joue à fond la carte de l’autonomie sans cabinet (déclarations URSSAF, TVA, impôt sur le revenu intégrées). Si vous préférez un comptable, choisissez la PA en concertation avec lui — Pennylane et Tiime ont les écosystèmes cabinet les plus matures.

Comment ça marche pour les factures aux particuliers (B2C) ?

Les factures B2C ne transitent pas en e-invoicing (pas de PA destinataire — un particulier n’a pas de compte PA). Elles relèvent du e-reporting : vous transmettez à votre PA les données agrégées (montant, TVA si applicable, date) qui les remontent à l’administration fiscale. C’est plus léger qu’une facture B2B complète. Toutes les PA citées ici gèrent l’e-reporting nativement.

Quelle différence entre e-invoicing et e-reporting ?

• e-invoicing = transmission technique de la facture B2B française complète d’une PA à une autre (votre PA → PA de votre client). Format structuré obligatoire (Factur-X, UBL, CII).
• e-reporting = transmission à l’administration des données des transactions hors champ e-invoicing (ventes B2C, ventes export, achats import, encaissements). Format plus léger.

Les deux flux passent par la même plateforme — vous n’avez pas besoin de deux outils.

Puis-je continuer à envoyer mes factures par email ?

Oui — mais via une PA. La PA peut envoyer la facture en pièce jointe email à votre client, en plus de la transmission structurée à la PA destinataire. Côté visuel, votre client reçoit toujours un email avec un PDF — la différence est que le PDF est un Factur-X (PDF + XML embarqué) et que la donnée structurée a été transmise en parallèle à sa PA.

Combien de temps faut-il pour migrer ?

Compter 2 à 4 heures d’onboarding initial sur une PA simple comme Indy ou Tiime (paramétrage compte, validation SIRET, premiers modèles de facture). Plus 1 à 2 mois de double émission en parallèle pour valider le bon fonctionnement avant de basculer définitivement.

Sources

• Liste officielle des Plateformes Agréées — DGFiP — 138 immatriculées + 14 en attente, 152 au registre au 23/06/2026, source faisant foi
• Réforme facturation électronique — impots.gouv.fr — page officielle DGFiP
• URSSAF — auto-entrepreneur, déclarations — obligations déclaratives micro-entreprise
• Indy — tarifs — fetched 2026-05-03 (plan Essentiel gratuit, Plus 9 €/mois HT, Premium (voir grille publique⁸))
• Tiime — tarifs — fetched 2026-05-03 (Free gratuit à vie, Smart 17,99 €/mois HT, Business 24,99 €/mois HT)
• Pennylane — tarifs — fetched 2026-05-03 (Basique 14 €/mois HT, Essentiel 24 €/mois HT, Premium 79 €/mois HT)
• Article 1737 du CGI — sanctions e-invoicing — amende 50 €/facture, plafond annuel 15 000 €
• Article 1788 D du CGI — sanctions e-reporting — amende 500 €/transmission manquante, plafond annuel 15 000 €

Calendrier détaillé · Obligations TPE/PME · Sanctions 2027 · Annuaire des PA · Comparatif côte-à-côte · Notre méthode